Аспирантура является основной формой подготовки научно-исследовательских и научно-педагогических кадров.
Аспирантура в МВШМ проходит в очной (3 года) и заочной (4 года) формах. Во время обучения аспиранты готовятся по индивидуальным учебным планам, публикуют статьи в рецензируемых журналах, сдают кандидатские экзамены (история и философия науки, иностранный язык, государственный язык, специальный предмет в соответствии с темой диссертации), экзаменуются по дополнительным дисциплинам, таким как «Школа педагогического мастерства» и «Методология и методика научных исследований».
По результатам обучения в аспирантуре студенты подготавливают диссертации с проведением их публичной защитой в соответствующих диссертационных советах.